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无处不在的组蛋白修饰

发布时间:2018-09-26 16:18 |  点击次数:

2018 年 5 月 11 日,浙江万里学院葛楚天,钱国英及杜克大学 Blanche Capel 研究组合作在顶尖学术期刊 Science 杂志发表题为「The histone demethylase KDM6B regulates temperature-dependent sex determination in a turtle species 」 探究组蛋白的甲基化对巴西龟性别决定的影响。2018 年 8 月 30 号,香港大学课题组在 Nature Communications 发文「Lysine benzoylation is a histone mark regulated by SIRT2」,发现新的组蛋白修饰--赖氨酸苯甲酰化对生命活动的影响。2018 年 9 月 13 日,中科院上海药物所在 Cell 发文「Targeting Epigenetic Crosstalk as a Therapeutic Strategy for EZH2-Aberrant Solid Tumors」探究 H3K27me 和 H3K27ac 对肿瘤发展的影响,指导联合用药。组蛋白修饰作为表观遗传学研究热点,持续出现在高分杂志上,依旧是当然研究的重点领域。

简单介绍下组蛋白

组蛋白是染色体基本结构-核小体中的重要组成部分,由 4 种组蛋白 H2A、H2B、H3 和 H4 各两个分子,形成一个组蛋白八聚体,长度约为 146bp 的 DNA 分子盘绕在组蛋白八聚体构成的核心结构外面,形成了一个核小体。每个核心组蛋白 N-末端氨基酸残基可发生乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、多聚 ADP 糖基化等多种共价修饰作用。组蛋白修饰在生命过程中起着非常重要的作用,人类很多疾病的发生与组蛋白修饰有着密切关系。

 


组蛋白研究技术手段

在生理状态下用甲醛把细胞内特定修饰的组蛋白和 DNA 交联在一起,超声波将其打碎到一定长度范围的染色质小片段,通过运用对应于一个特定组蛋白修饰的抗体,将目标片段(组蛋白发生特异修饰的片段)沉淀下来,对目的片段纯化和测序,得到相关基因片段信息。

组蛋白案例分析:

《GenomeWide Analysis of Histone Modifications:H3K4me2, H3K4me3, H3K9ac, andH3K27ac inOryza sativa L. Japonica》文章中使用染色质免疫沉淀结合高通量测序(CHIP-seq)的方法研究了 H3K4me2、H3K4me3、H3K9ac 和 H3K27ac 这 4 个组蛋白修饰在水稻中全基因组分布。通过分析发表的 DNase-seq 数据,本研究探索了沿着水稻基因组的 DNase 超敏 (DH) 位点。组蛋白修饰主要出现在基因区,并围绕着基因的转录起始位点(TSSs)富集。这项分析证明 4 种组蛋白修饰和 DNase 超敏位点都与活性转录相关。此外,4 种组蛋白修饰高度同时出现在转录区,推测其为一种用来为一种用来预测水稻基因注释中缺失基因的可能特征。进一步研究验证了该预测,确证了两个预测的缺失基因的转录。与此同时,改研究还构建了一个序列模体分析的方法以鉴定 DH 位点和许多推断的转录因子结合位点。

 

武汉爱基百客生物科技有限公司(爱基百客)作为国内提供 ChIP-seq 技术服务的翘楚,ChIP-seq 服务涉及物种 50+,组织类型 25+,组蛋白修饰的 ChIP-seq 服务更是与国内众多课题组都有着长期合作。除此之外,转录因子等蛋白质与 DNA 互作服务,爱基百客都有着丰富的经验。武汉爱基百客作为一家专业提供表观遗传学技术服务的生物公司,希望在表观遗传学领域为各位老师科研雪中送炭锦上添花。

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